Sekilas, Ibara Naruse dan teman-temannya Aoi Fukasaku dan Taeko Nomura terlihat seperti siswa sekolah menengah biasa yang riang. Tapi jalan yang mereka lalui, tujuan mereka, dan lingkungan sekitar sama sekali tidak normal. Saat mereka terus maju, ketiganya menemukan diri mereka sendiri melangkah lebih dalam ke versi Tokyo yang tidak dapat dihuni, yang telah dirusak oleh bencana nuklir 20 tahun lalu.
Sebagai bagian dari Dispatch 3rd Special Force Coppelion, yang dikenal sebagai tim Perawatan Kesehatan, Ibara, Aoi, dan Taeko didukung oleh Pasukan Bela Diri Darat Jepang (JGSDF) dan Kolonel Onihei Mishima saat mereka menjelajahi jalanan yang sunyi untuk mencari orang yang selamat. Menemukan manusia terakhir yang tersisa dan mengevakuasi mereka dengan helikopter JGSDF adalah kejadian sehari-hari bagi para gadis. Namun seiring berjalannya pekerjaan mereka, Ibara dan teman-temannya mulai mempertanyakan kemanusiaan mereka sendiri—yaitu, bagaimana mereka sendiri dapat melakukannya bertahan hidup di Tokyo tanpa alat pelindung apapun.
